传说在四川大巴山深处，有一个青年帮助老中医照料药园。一年冬天，他在后山坡偶然发现一朵黄绿色的小花，迎着凛冽的寒风独自开放。他好奇地把它连根挖出，移栽在药园子里。从此他经常浇水施肥，这株绿色的花草长得枝叶繁茂。一天，老医生有个名字叫桂花的女儿得了急病，发冷、发烧、大便带脓血、便次增多，仅仅两三天就神志不清了。这时老医生外出行医未归，小伙子十分焦急。他突然想起有一次喉咙痛，摘下园里那棵小花的一两片叶子嚼了嚼，喉咙竟不痛了。他急忙从园子里拔了一棵，熬水送给桂花喝了，桂花的病渐渐好起来。老医生回来后连声称赞说：“看来这黄绿花的小草对清热燥湿解毒真有特效！”这位青年姓黄名连，后人为了纪念他，便把这小草定名为黄连。
黄连别名玉连、支连，为毛茛多年生草本植物黄连的根茎，主产四川、湖北等地。秋季采挖，去须根及泥土，晒干，生用，酒炒、姜汁炒、吴茱萸水炒用，用时捣碎。黄连味苦性寒，归心、胃、肝、胆、大肠经。具清热燥湿，清心除烦，泻火解毒之功效。
中医常用黄连配合其他药物治疗一些疾病，比如，因心胃火热引起的心下痞满、脘腹热痛、口舌生疮、目赤牙痛、便秘尿赤；因血分热毒郁积而致的疮疡疖肿；因温病热邪入心而致的神昏谵语、烦躁不宁、汗出口渴、身热舌红、心烦失眠等诸症。
黄连还有清肝明目的作用。中成药黄连羊肝丸主治肝经火盛、血虚不荣导致两目昏、视物不清、羞明怕日、雀目夜盲、胬肉攀睛等症。用黄连煎水，外用洗目，可治目赤目痛、火眼暴发。
黄连燥湿止痢功效明显。因湿热食滞而致的痢疾，常以黄连配木香、白芍、当归、槟榔、黄芩、白头翁、茯苓、厚朴、枳实同用。治疗口腔炎、尿路感染常用黄连9克，生地15克、竹叶9克，木通、甘草各6克，水煎服。治萎缩性鼻炎可用黄连3克，煎汁一酒杯，大蒜头一瓣捣烂，混合搅汁，滴鼻，每日3？觸5次。治滴虫性阴道炎可用黄连18克，煎水1000毫升，用吸脓球或注射器吸取黄连水冲洗阴道，每日1次。
使用黄连应注意不可过量，否则会造成“苦寒伤胃”的不良反应如消化不良、食欲减退、恶心呕吐等。黄连性燥，多用易伤津液，宜与养阴药同用。凡脾胃虚寒非有湿热实火者请慎用。
现代研究发现，黄连的有效成分黄连素（小蘖碱）具有广谱抗菌作用，对痢疾杆菌的抑制作用最强，优于磺胺类药物。
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